Vitoria có tổ tiên converso Do Thái và lớn lên ở Burgos,[5] là con trai của ông Pedro de Vitoria, của Alava, và bà Catalina de Compludo, cả hai đều xuất thân gia đình quý tộc.[6] Ông trở thành dòng Đa Minh năm 1504, và học hành ở College Saint-Jacques ở Paris, nơi ông đã chịu ảnh hưởng bởi tác phẩm của Desiderius Erasmus. Ông đã đi giảng dạy thần học từ năm 1516 (dưới những ảnh hưởng của Pierre Crockaert và Thomas Cajetan). Năm 1522, ông quay về Tây Ban Nha giảng dạy thần học tại trường Cao đẳng Saint Gregory tại Valladolid, nơi nhiều người Dominica trẻ đang dược đào tạo cho công tác truyền giáo ở Tân thế giới. Năm 1524, ông được bầu làm Chủ tịch thần học tại Đại học Salamanca, nơi ông có công trong việc đẩy mạnh học thuyết Thomas (triết học và thần học của St. Thomas Aquinas). Francisco qua đời tháng 8 năm 1546.[7]